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新方法提升了非结核分枝杆菌鉴别的明确性

2021-8-27 15:29| 发布者: wdb| 查看: 104| 评论: 0|原作者: [db:作者]|来自: [db:来源]

摘要: 新方法提升了非结核分枝杆菌鉴别的明确性 ,更多it技术解析新闻关注我们。

细菌属分枝杆菌具备可疑的荣誉,包括负责两种最着名的慢性人类传染病:结核病和麻风病的物种。但与它们更为着名的堂兄弟不同,长久以来一直有用的治疗战略,近200种左右的分枝杆菌物种日前正好引起肺病的复发。

这点物种统称为非结核分枝杆菌(NTM),广大存留于土壤和水中。可是,假如有机会,NTM可行在易感患者中引起惨重的皮肤和肺部感染。治疗NTM感染的第一大阻碍之一是难以区别细菌,特别是在亚种水准。然则,明确鉴别至关要紧,由于不同的物种对不同的抗生素疗法体现出不同水平的反映。

为理解决缺乏明确和感性的NTM鉴别方法,大阪大学和琉球大学的探讨小组开发了鉴于细菌基因序列数据可靠鉴别NTM的软件。在本月发表的新兴微生物和感染论文中,探讨人士解释了它们如何开发该软件及其对治疗NTM感染的意义。

“在日前的NTM鉴别方法中,最感性和最明确的是鉴于基因组消息,”作者Shota Nakamura说。“然则,虽然公认须要高品质的基因组数据,应允NTM鉴别到亚种水准,但日前的数据库只包涵148种物种的装配。因而,在这项探讨中,咱们对此外27种物种的基因组发展了测序,并从新测序了基因组。 36种。“

探讨人士应用它们新得到的序列以及7,484个先前发表的基因装配配,开发了一种鉴于184个独立基因序列鉴别的175个NTM物种的概括数据库。称为多位点序列分型,可行经过184个基因内的序列差异的特定组合来区别每个物种。该数据库还包括其它分枝杆菌种类用于相比。

“一朝咱们装配了数据库,咱们开发了名为mlstverse的软件,它将未知序列与数据库发展相比,从而明确辩别NTM,”该探讨的最重要的作者Yuki Matsumoto解释道。“当咱们将咱们的方法与其它方法发展相比以鉴别 29种临床NTM分离株时,mlstverse是确定全部29种亚种水准的分离株的独一方法。”

在可能的利用是有前途的,武金城,一种医生在琉球大学医院,说:“这类方法可能会被用以从临床标本鉴别NTM,使靶向治疗的实行和提升治愈率NTM相干感染“。

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