
期望下降探讨难度并在用具带中添加新的计算用具的科学家可行探寻Tapis名目。Tapis软件平台旨在帮助探讨人士更轻松地应用功效强盛的超等计算机,并集成和治理来源不同遥远来自的数据。
科学基金会(NSF)向德克萨斯顶级计算中心(TACC)和德克萨斯大学奥斯汀分校(UT Austin)授予了290万美元的资助,另外还向夏威夷大学(UH)提供了100万美元的奖励。NSF奖项于2019年9月最初,旨在扶持Tapis的持续开发,Tapis是TACC-API的缩写,从挂毯一词最初,将效劳和功效合一在一同。一种利用程序编程接口(API)是一种接口的软件体系已建成或改装的另一种程序运用。
“ Tapis是用于计算科学和计算探讨的探讨计算平台,”负责TACC的云计算和交互式计算小组的首席探讨员(PI)乔·斯塔布斯说。“ Tapis是一种软件体系,可行帮助探讨人士运用咱们在TACC和其它位置具有的超等计算机和其它类别的计算资源。”
“描画Tapis的最容易方法是,它是一种鉴于Web的利用程序,它提供了现代科学家发展数据稠密型,计算稠密型探讨所需的全部用具,”大学网站根基设备主管Co-PI Gwen A. Jacobs说。夏威夷体系。“ Tapis的与众不同之处之一是,它将探讨人士须要的全部要紧用具编织在一同。这便是Tapis的真实力量。”
Tapis将在运用计算用具发展探讨的进程中为具备不同不业余常识的各式使用者提供效劳。具有高档计算资源和编程经历的“顶级使用者”将是此中的一员。Tapis将帮助它们自动化和简单化大型的事业过程或软件利用程序管道。
在光谱的另一端,科学家才刚刚最初探寻将领先进步计算利用于它们的探讨的可能性。Stubbs说:“咱们正好尝试运用Tapis为它们做的事宜,是在超等计算机上运转计算程序的最容易方法。”
接下来是当中一种小组,平常是大型软件开发名目,专注于特定的探讨范畴,比如免疫学,天文学或生物消息学。
Stubbs说:“ Tapis的指标是使探讨人士能够以愈加使用者友没有问题形式访问这点计算资源。”
由NSF资助的计算资源被广大描画为网站根基设备,即探讨人士共享的在线生态体系,由顶级计算资源作为后盾,托管在数据中心中,并获得行家的扶持。“那一些网站根基设备名目的Web开发人士团队和其它开发人士可行应用Tapis更快地建立其网站根基设备名目。”
为这,一种示例是TAPIS API构架对传播感器数据的扶持,此中在繁杂的事业过程中,一种事故(比如,对传感器阵列的检验)可能触发另一种事故,依此类推,甚而是若干剖析例程。
雅各布斯解释说:“事故驱动的计算意指着事业流却非一直在运转。关于那一些须要从传感器和数据等来自获取数据的科学家来讲,这是一种很棒的功效上传。这意指着它们不必手动运转全部代码。事业流构建以后,就能发展免提计算,从而实现免提剖析。”
Tapis将整合由地球科学基金会(NSF)资助的EarthCube构成的地球科学(CHORDS)名目云托管实时数据效劳,以实现事故驱动的计算。
从某种意义上说,利用于科学的API应允不同的体系相互通信。Stubbs说:“运用Tapis的想法是要有个机器可读和易用的接口来接连计算资源,比如超等计算机,另有高功能的存储体系,比如咱们的Corral存储体系或咱们的全局文献体系,Stockyard,以及咱们期望具有一种易于在其它程序中访问和操作的界面。”
Tapis将提供的另一种功效是新的平安内核,其效用相似于操控对体系资源的访问的门。Tapis平安内核将被扩散化,使科学家可行更轻松地站立本人的利用程序并保存对机密数据的当地操控。
夏威夷大学网站根基设备探讨科学家Co-PI Sean Cleveland说:“新的平安内核使咱们能够提供往日达成的全部托管平安性,身份认证和受权。”“可是它还将应允数据中心和机构部署本人的平安内核,以便它们可行运用本人的使用者凭据并以本人的形式治理本人的平安性,以及在其机构中部署构架的各个组件,而且能够应用少许聚集的事业,这是一种运用科学即效劳,平台即效劳的新款混合体系,可是假如您想要更多的操控和定制功效,则可行在现场部署较小的组件况且依然能够应用少许较大的托管组件来满足不同的要求。”
Tapis将为使用者提供简单化组建利用程序的进程的能力,这是科学家的强盛用具。雅各布斯说:“假如您可行对事业过程发展编程,并使该事业过程在Tapis这样的平台上运转,则可行简单化过程,由于全部组件都可行更轻松地相互交流。”“这意指着探讨人士必需建立一次该事业过程。接下来,它们将该事业过程另存为Tapis根基架构中的利用程序并循环运用。”
保留软件环境的全部参数也将使科学家能够在今后再一次返回并再一次运转数据剖析,从而提升了科学可循环性。
Stubbs解释说:“这实质上是TACC与夏威夷大学之中的完整合作。”
TACC在高功能计算和建立分布式软件体系方面具有广大的不业余常识。虽然TACC的某些组件将在NSF资助的Jetstream云上运转,但Tapis的组件自身可行在商品效劳器或现成的效劳器上运转。
UH的团队成员正好为Tapis体系的开发,设置和体制构造做出奉献。更要紧的是,他们为气候,海洋,珊瑚礁,人类微生物组以及围绕健康差异的人数探讨等范畴的夏威夷提供了大批要紧的范畴探讨消息。
雅各布斯说:“在夏威夷为咱们提供Tapis名目,关于将领先进步的网站根基设备利用到数据稠密型科学中,是一种庞大的认识提高。”“无这样的名目,咱们的众多探讨人士可能不会意识到这点资源。”
探讨人士正好努力的最重要的路程碑之一是在2020年夏季为早期采纳者举行的年终研讨会。“咱们的想法是举行一次研讨会,邀请探讨人士参与,带来它们的数据集,以提供应探讨者。不但推荐了它们的科学和用例,况且还让Tapis团队在第逐年底此前推荐了体系的功效。”
TACC顶级计算接口主管Co-PI Maytal Dahan显示:“咱们十分高兴能够发动由NSF资助的新Tapis名目。“ Tapis将经过推进强盛的网站根基设备功效和效劳的发觉,访问和运用来改变科学家的制造力。咱们期望经过提供各式平安可靠的API效劳来下降达成科学的繁杂性并缩小产物到市场时间。可行在制造品质的环境中为咱们的使用者提供扶持。
TACC团队将在名目的各个方面事业-开发平安内核,流数据API和集成,品质确保和持续集成测试,外展,培训和员工开发。咱真的为TACC和UH的团队感觉骄傲,咱们都热心从一最初就经过咱们的早期采纳者计划与科学界合作,以组建对科学界发生踊跃作用的效劳。”
Tapis名目是“持续创新网站根基设备”(CSSI)的一部分,该名目是由顶级网站根基设备办公室(OAC)牵头的NSF跨范畴计划。“ CSSI扶持创新的网站根基设备的进行,使探讨人士社区能够接着并提速NSF扶持的全部根基科学和工程范畴的进步,”治理该奖项的OAC计划主任Stefan Robila博士说。“经过在先前的事业根基上,并应用现存的领导力计算资源(如TACC可得到的资源),Tapis有助于不停加强网站根基设备,同一时间下降了获取网站根基设备的阻碍。”
更多技艺剖析关心咱们。